Mikroskop terbalik adalah mikroskop optik dengan sumber cahaya dan lensa kondensor yang terletak di atas tahap sampel, sedangkan lensa objektif terletak di bawah tahap sampel. Konfigurasi ini berlawanan dengan mikroskop tradisional (vertikal). Desain terbalik membuatnya lebih mudah untuk menangani sampel cair dan spesimen yang lebih tebal, karena gravitasi menjaga spesimen tetap di tempatnya tanpa slip penutup.
